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Projetos de Pesquisa

 

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Afonso Luís Barth

Ciências Biológicas

Microbiologia
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  • monitoramento e vigilância de bactérias multirresistentes através da abordagem multiômica
  • Recentemente, o elevado consumo de antimicrobianos, como os carbapenêmicos e as polimixinas, tem sido bastante frequente em unidades de terapia intensiva (UTIs) brasileiras, já que muitos isolados bacterianos apresentam resistência a praticamente todos antimicrobianos disponíveis. Nesse contexto, a detecção precoce de infecção primária de corrente sanguínea bem como a identificação do mecanismo de resistência clinicamente relevantes diretamente da amostra de sangue total tem o potencial de reduzir significativamente a mortalidade por orientar melhor a terapia antimicrobiana a ser instituída. Somado a isso, a detecção precoce de surtos é extremamente importante para limitar a disseminação de bactérias multirresistentes (MDR) e implementar rapidamente medidas de controle. Assim, este projeto se propõe a estudar os mecanismos envolvidos na disseminação de bacilos Gram-negativos resistentes aos carbapenêmicos (BGN-CR) e de Staphylococcus aureus resistentes à meticilina (MRSA) ou com resistência plena ou intermediária à vancomicina (VRSA/VISA) utilizando ferramentas genômicas como o Sequenciamento Completo do Genoma, além de desenvolver e/ou validar métodos rápidos genotípicos (PCR-digital) e fenotípicos (baseados em proteômica – espectrometria de massas, MALDI-TOF; e em perfil de metabólitos – espectroscopia de infravermelho por Transformada de Fourier, IR-Biotyper) que possam ser implementados na rotina laboratorial do SUS com custos reduzidos. Para isso, selecionaremos 200 isolados de BGN-CR e MRSA, VRSA/VISA para o estudo de vigilância genômica e detecção precoce de surtos, além do desenvolvimento de métodos rápidos de diagnóstico baseado em PCR digital.
  • Hospital de Clínicas de Porto Alegre - RS - Brasil
  • 11/01/2024-31/01/2027
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Afonso Luís Barth

Ciências Biológicas

Microbiologia
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  • aplicação de tecnologias ômicas no estudo e monitoramento de bacilos gram-negativos coprodutores de carbapenemases
  • A resistência antimicrobiana (RA) tem sido uma crescente ameaça para o tratamento de um grande número de infecções causadas por bactérias. Neste cenário, infecções causadas por Bacilos Gram Negativos multirresistentes, especialmente Enterobacterales, P. aeruginosa e A. baumannii coprodutores de carbapenemases (BGN-CPC), aumentaram gradualmente nos últimos anos e tornaram-se um desafio de saúde pública devido às limitadas opções terapêuticas e a alta mortalidade. Dados recentemente publicados pela ANVISA, demonstraram um aumento superior a 300% nos anos de 2018 e 2019 na detecção de isolados coprodutores de carbapenemases no Brasil, sendo K. pneumoniae a espécie mais frequente carreando blaKPC e blaNDM, que foi a principal combinação encontrada. Dados do nosso laboratório também demonstram um aumento elevado na coprodução de NDM e KPC nos últimos anos. Entretanto, cabe ressaltar que a triagem destas cepas nos laboratórios clínicos é bastante limitada e portanto não se conhece a prevalência real. Além disso, a emergência de BGN-CPC tem implicações clínicas, laboratoriais e de saúde pública. Novas combinações de beta-lactâmicos/inibidores de beta-lactamases aumentaram as opções de tratamento destas infecções, principalmente em isolados coprodutores de beta-lactamases da classe A (KPC) e D (OXA-48, OXA-23). Entretanto, o aumento de isolados carreando uma metalo-beta-lactamase (por exemplo, NDM) e uma serino-beta-lactamase (por exemplo, KPC) reduzem a eficácia terapêutica destas combinações. Assim, a rápida identificação e diferenciação entre as várias carbapenemases é a chave para o início precoce de uma terapia efetiva. Deste modo este projeto se propõe a estudar os mecanismos envolvidos na disseminação de BGN-CPC utilizando ferramentas genômicas como o WGS, além de desenvolver e/ou validar métodos rápidos genotípicos (PCR-digital) e fenotípicos (baseados em proteômica - MALDI-TOF) que possam ser implementados na rotina laboratorial.
  • Hospital de Clínicas de Porto Alegre - RS - Brasil
  • 14/12/2022-30/06/2025
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Afonso Rangel Garcez de Azevedo

Engenharias

Engenharia de Materiais e Metalúrgica
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  • potencial de reutilização do coral-sol (tubastraea spp.) no desenvolvimento de materiais de construção sustentáveis
  • A indústria da construção civil vem demandando cada vez mais de recursos naturais para seus diferentes materiais. Por outro lado, há atualmente no país uma grande dispersão do coral-sol (Tubastraea spp.) em seu litoral, que é considerada uma espécie exótica invasora com grandes impactos ambientais e econômicos. O coral-sol é um sério problema no setor portuário brasileiro, que vem em uma crescente expansão, devido aos elevados custos relacionados ao seu controle. Considerando a sua composição típica, há uma potencialidade de sua aplicação no desenvolvimento de materiais sustentáveis para a construção civil. O objetivo deste projeto de pesquisa é avaliar o potencial de reutilização do coral-sol (Tubastraea spp.), oriundo da atividade de um porto privado no norte do estado do Rio de Janeiro, no desenvolvimento de materiais de construção sustentáveis, avaliando assim a sua viabilidade técnica. Esse projeto se justifica pelo viés: (i) ambiental, pois essa espécie além de invasora gera danos ao meio ambiente e a população; (ii) econômica, pelo fato dos elevados custos de sua remoção; (iii) tecnológica, para o desenvolvimento de um material de construção com propriedades adequadas. Há ainda a questão de redução do consumo de matéria prima na produção dos materiais da construção tradicionais. A sua composição rica em calcário, pode ser um forte indicativo de seu potencial de aplicação em materiais cimentícios, que será avaliado através do programa experimental que prevê a análise completa de técnicas de coleta, processamento e homogeneização do material visando a sua aplicação em pastas e argamassas cimentícias, assim como a sua caracterização. Assim, será possível à análise de parâmetros tecnológicos no estado fresco, endurecido, quanto a sua reologia, durabilidade e condição microestrutural. Espera-se que, o coral-sol possa ser validado com um promissor resíduo a ser utilização em materiais cimentícios sustentáveis, resolvendo um grande problema aos portos brasileiros.
  • Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro - RJ - Brasil
  • 04/12/2023-31/12/2026
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Afranio Lineu Kritski

Ciências da Saúde

Medicina
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  • avaliação da acurácia, impacto clínico e custo efetividade da implementação do t-ngs no diagnóstico precoce e monitoramento de tb droga resistente
  • Desde 2015 registra-se um aumento da TB droga resistente (DR) no Brasil e no mundo. Globalmente estima-se que em 2021, 10,6 milhões de pessoas adoeceram por TB, cerca de 500.000 pessoas desenvolveram TB resistente à rifampicina (TB-RR), das quais 78% tinham TB multirresistente (TB-MDR). Recentemente, observou-se aumento da TB-DR em pacientes sem tratamento anterior, chamada TB-DR primária, associado ao aumento da transmissão do bacilo resistente aos fármacos na comunidade. A detecção de TB-MDR/RR requer confirmação bacteriológica e testes de resistência aos medicamentos por meio de testes moleculares, métodos de cultura ou tecnologias de sequenciamento. Entre os casos notificados com TB confirmada, apenas 61% dos pacientes tiveram suas amostras analisadas pelo Xpert MTB RIF, recomendado pela OMS desde 2010. Entre pacientes com MDR/RR-TB, apenas 42,9% foram diagnosticados, e desses 36,9% iniciaram tratamento. Em recentes meta-análises observou-se que o uso do Xpert MTB RIF não reduziu a mortalidade ou o abandono do tratamento. Em 2023, a OMS recomendou o uso do Target New Generation Sequencing (T-NGS) em amostras clínicas, pois o novo método diagnóstico tem o potencial de orientar o manejo clínico dos pacientes, gerar dados para a formulação de políticas e melhorar o desenvolvimento de testes diagnósticos, mas inexistem dados sobre avaliação econômica. Em 2021, o Ministério da Saúde incorporou o Line Probe Assay (LPA) no SUS para agilizar a detecção de resistência aos fármacos de 1ª e 2ª linha. A partir de 2019 têm sido incorporados novos fármacos (por ex.: bedaquilina) na rotina de atendimento de pacientes com TB no Brasil, no entanto são escassos os laboratórios que realizam teste de sensibilidade fenotípico ou genotípico para estes fármacos. No presente projeto, por meio do uso do T-NGS, pretende-se: a) agilizar a detecção da TB-MDR/XDR de modo a proporcionar o uso imediato de tratamento anti-TB adequado; b) expandir a cobertura dos testes de resistência aos novo
  • Universidade Federal do Rio de Janeiro - RJ - Brasil
  • 12/12/2023-31/12/2026
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