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Rodrigo Cayô da Silva

Ciências Biológicas

Microbiologia
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  • criação da rede brasileira de monitoramento de genes de resistência e patógenos multirresistentes emergentes em ecossistemas microbianos de manguezais e restingas - rede artemis
  • Os manguezais e restingas são ecossistemas costeiros complexos encontrados em zonas tropicais e subtropicais, oferecendo um habitat único que promove uma conexão entre os ambientes marinhos e terrestres. A microbiota dos manguezais e restingas é composta por uma diversidade de espécies, que contribuem significativamente para os ciclos biogeoquímicos, desempenhando papéis essenciais para o funcionamento e manutenção dessa biosfera. Além de moldar o ecossistema, as comunidades microbianas são uma importante fonte de compostos com potencial biotecnológico. Entretanto, o aumento de poluentes em áreas de manguezais e restingas tem atuado como promotores da resistência aos antimicrobianos. Neste contexto, estudos recentes têm reportado uma alta frequência de genes de resistência a metais pesados e aos antimicrobianos em áreas de manguezais e restingas em vários países. Embora esses biomas no Brasil tenham sido extensivamente estudados para vários fins ecológicos, pesquisas focadas na caracterização da distribuição e função de suas comunidades microbianas ainda não foram adequadamente exploradas. Devido às lacunas no conhecimento sobre essas populações de microrganismos decidimos criar a Rede ARTEMIS objetivando caracterizar e catalogar a diversidade microbiana em todas as áreas de manguezais e restinga presentes no país, avaliando seu potencial patogênico e biotecnológico. De forma pioneira, a Rede ARTEMIS é composta por 11 centros nacionais localizados em nove estados litorâneos e 4 centros internacionais, totalizando 17 pesquisadores além de vários alunos de pós-graduação/graduação, e engloba cinco projetos associados que visam a criação de uma coleção nacional de microrganismos desses biomas, verificar a contaminação por antimicrobianos/metais pesados, prospectar os possíveis impactos do aquecimento global/ação antrópica nas comunidades microbianas desses ecossistemas e caracterizar molecularmente isolados bacterianos e fúngicos multirresistentes.
  • Universidade Federal de São Paulo - SP - Brasil
  • 13/12/2023-31/12/2026
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Rodrigo Cayô da Silva

Ciências Biológicas

Microbiologia
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  • programa de monitoramento de ecossistemas microbianos fluviais e sua relação com a emergência e disseminação de patógenos multirresistentes no brasil: projeto prometeus
  • Os rios têm recebido uma carga de resíduos, incluindo antimicrobianos, favorecendo a transferência de ARGs entre bactérias patogênicas e ambientais, e pressão seletiva sobre fungos. Portanto, o saneamento básico precário no Brasil é preocupante, uma vez que uma alta frequência de colonização intestinal por BGNs MDR foi relatada na comunidade em países em desenvolvimento associada ao consumo de água contaminada. Assim, nosso objetivo é detectar a presença de patógenos MDR e de novos ARGs em ecossistemas aquáticos no Brasil, a partir da análise de amostras de água dos maiores rios (Amazonas, Paraná, São Francisco, Tocantins, Parnaíba, Uruguai, Paraíba do Sul e Rio Doce) das principais bacias hidrográficas. Serão coletadas amostras de água de três pontos distintos (4 L/ponto) de cada rio selecionado. As coletas ocorrerão no verão e inverno e as amostras de água serão mantidas a 4ºC, até o seu processamento, para cultivo de bactérias, fungos e extração de DNA total (detecção de micro-organismos não cultiváveis). Amostras de água potável serão coletadas próximo aos pontos de coleta. As amostras serão filtradas em membranas 0.45 µm, incubadas em TSB/4h, e semeadas em placas de CHROMagarTM, Bile Esculina e Manitol contendo diferentes antimicrobianos. Para a seleção de fungos, as amostras de água serão semeadas em seis diferentes meios de cultura. O gênero/espécie dos isolados será identificado por MALDI-TOF MS MS e provas bioquímicas ou por macro/micromorfologia da colônia. Os isolados serão armazenados a -20ºC. O teste de sensibilidade aos antimicrobianos será realizado por disco-difusão e diluição em ágar (bactérias), principalmente, e por microdiluição em caldo (fungos). Diferentes ARGs serão triados por PCR nos isolados bacterianos de acordo com o fenótipo de resistência, enquanto os isolados de fungos MDR terão os genes de interesse sequenciados. Cepas apresentando fenótipos MDR e/ou genótipos de interesse serão submetidas ao sequenciamento de genoma completo.
  • Universidade Federal de São Paulo - SP - Brasil
  • 05/12/2023-31/12/2026
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