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Projetos de Pesquisa

 

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Afonso Luís Barth

Ciências Biológicas

Microbiologia
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  • monitoramento e vigilância de bactérias multirresistentes através da abordagem multiômica
  • Recentemente, o elevado consumo de antimicrobianos, como os carbapenêmicos e as polimixinas, tem sido bastante frequente em unidades de terapia intensiva (UTIs) brasileiras, já que muitos isolados bacterianos apresentam resistência a praticamente todos antimicrobianos disponíveis. Nesse contexto, a detecção precoce de infecção primária de corrente sanguínea bem como a identificação do mecanismo de resistência clinicamente relevantes diretamente da amostra de sangue total tem o potencial de reduzir significativamente a mortalidade por orientar melhor a terapia antimicrobiana a ser instituída. Somado a isso, a detecção precoce de surtos é extremamente importante para limitar a disseminação de bactérias multirresistentes (MDR) e implementar rapidamente medidas de controle. Assim, este projeto se propõe a estudar os mecanismos envolvidos na disseminação de bacilos Gram-negativos resistentes aos carbapenêmicos (BGN-CR) e de Staphylococcus aureus resistentes à meticilina (MRSA) ou com resistência plena ou intermediária à vancomicina (VRSA/VISA) utilizando ferramentas genômicas como o Sequenciamento Completo do Genoma, além de desenvolver e/ou validar métodos rápidos genotípicos (PCR-digital) e fenotípicos (baseados em proteômica – espectrometria de massas, MALDI-TOF; e em perfil de metabólitos – espectroscopia de infravermelho por Transformada de Fourier, IR-Biotyper) que possam ser implementados na rotina laboratorial do SUS com custos reduzidos. Para isso, selecionaremos 200 isolados de BGN-CR e MRSA, VRSA/VISA para o estudo de vigilância genômica e detecção precoce de surtos, além do desenvolvimento de métodos rápidos de diagnóstico baseado em PCR digital.
  • Hospital de Clínicas de Porto Alegre - RS - Brasil
  • 11/01/2024-31/01/2027
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Afonso Luís Barth

Ciências Biológicas

Microbiologia
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  • aplicação de tecnologias ômicas no estudo e monitoramento de bacilos gram-negativos coprodutores de carbapenemases
  • A resistência antimicrobiana (RA) tem sido uma crescente ameaça para o tratamento de um grande número de infecções causadas por bactérias. Neste cenário, infecções causadas por Bacilos Gram Negativos multirresistentes, especialmente Enterobacterales, P. aeruginosa e A. baumannii coprodutores de carbapenemases (BGN-CPC), aumentaram gradualmente nos últimos anos e tornaram-se um desafio de saúde pública devido às limitadas opções terapêuticas e a alta mortalidade. Dados recentemente publicados pela ANVISA, demonstraram um aumento superior a 300% nos anos de 2018 e 2019 na detecção de isolados coprodutores de carbapenemases no Brasil, sendo K. pneumoniae a espécie mais frequente carreando blaKPC e blaNDM, que foi a principal combinação encontrada. Dados do nosso laboratório também demonstram um aumento elevado na coprodução de NDM e KPC nos últimos anos. Entretanto, cabe ressaltar que a triagem destas cepas nos laboratórios clínicos é bastante limitada e portanto não se conhece a prevalência real. Além disso, a emergência de BGN-CPC tem implicações clínicas, laboratoriais e de saúde pública. Novas combinações de beta-lactâmicos/inibidores de beta-lactamases aumentaram as opções de tratamento destas infecções, principalmente em isolados coprodutores de beta-lactamases da classe A (KPC) e D (OXA-48, OXA-23). Entretanto, o aumento de isolados carreando uma metalo-beta-lactamase (por exemplo, NDM) e uma serino-beta-lactamase (por exemplo, KPC) reduzem a eficácia terapêutica destas combinações. Assim, a rápida identificação e diferenciação entre as várias carbapenemases é a chave para o início precoce de uma terapia efetiva. Deste modo este projeto se propõe a estudar os mecanismos envolvidos na disseminação de BGN-CPC utilizando ferramentas genômicas como o WGS, além de desenvolver e/ou validar métodos rápidos genotípicos (PCR-digital) e fenotípicos (baseados em proteômica - MALDI-TOF) que possam ser implementados na rotina laboratorial.
  • Hospital de Clínicas de Porto Alegre - RS - Brasil
  • 14/12/2022-30/06/2025
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