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Silvya Stuchi Maria-Engler COORDENADOR(A)

Ciências da Saúde

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Título do Projeto:sin3b como gene emergente no melanoma: avaliação transcricional e triagem crispr/cas9
Resumo: O melanoma, um tipo de câncer de pele altamente mortal, é responsável pela maior taxa de mortalidade relacionada a doenças de pele em todo o mundo.A pesquisa dos genes envolvidos no desenvolvimento do melanoma é de extrema importância para a proposição de estratégias terapêuticas mais eficazes. Um gene emergente identificado por nosso grupo (Oliveira et al, 2017) denominado SIN3B, codifica uma proteína de suporte que faz parte do complexo de repressão transcricional SIN3B histona desacetilises 1 e 2 (SIN3B-HDAC1/2), que tem sido mostrado como um modulador da progressão do câncer. No entanto, o papel de SIN3B no melanoma e sua contribuição para o fenótipo da doença ainda são desconhecidos. Em um estudo realizado por Matsuyama, Tese de doutorado, 2021, nosso grupo realizou um estudo utilizando a metodologia CRISPR-Cas9 para deletar o gene SIN3B, a fim de investigar seu papel na biologia do melanoma humano. A pesquisa incluiu experimentos in vitro de biologia celular, análise transcricional e triagem CRISPR. Foram criadas sequências de RNA guia entre os éxons 2 e 3 do gene SIN3B humano, resultando em três clones knockout e três clones controle em linhagens de melanoma (SKMEL28, A2058, A375). Essas células foram analisadas através de duas estratégias de caracterização funcional: sequenciamento de RNA total para análise do transcriptoma e rastreamento de genes sinteticamente letais com SIN3B, usando uma biblioteca de CRISPR que silencia todo o genoma. Portanto, o presente projeto objetiva: 1. ampliar os estudos transcricionais desenvolvendo uma avaliação abrangente da expressão do SIN3B, incluindo suas variantes de splicing codificadoras de proteínas, utilizando dados de transcriptoma de amostras de pacientes com melanoma do Atlas Genômico do Câncer (TCGA) e, 2. Analisar, por sequenciamento de transcriptoma, os possíveis alvos do SIN3B e as vias biológicas envolvidas pela perda do SIN3B.
Instituição/UF/País: Universidade de São Paulo - SP - Brasil
Vigência: 05/12/2023-31/12/2026

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