Projetos de Pesquisa

 

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Taciane Finatto

Ciências Agrárias

Agronomia
  • análise do transcritoma de arracacia xanthorrhiza bancroft em resposta ao estresse por calor
  • A mandioquinha salsa (Arracacia xanthorrhiza Bancroft) é uma espécie da família Apiaceae cujas raízes apresentam grande interesse econômico e qualidade nutricional. Exige clima ameno (temperatura média anual entre 15 e 18 °C) e baixa amplitude térmica durante o seu ciclo (cerca de 8 meses até a colheita). Os padrões de aumento de temperatura diante das mudanças climáticas e oscilações nas temperaturas podem acarretar a redução da produção, inviabilizando o cultivo. O fenótipo evidencia que algumas cultivares são tolerantes ao calor, porém são desconhecidos seus mecanismos moleculares. Para este tipo de estudo é necessário que as sequências de transcritos estejam disponíveis, porém A. xanthorrhiza não apresenta genoma completo sequenciado, apenas as sequências do genoma do cloroplasto, inviabilizando o estudo. Nestre trabalho propomos analisar o transcritoma de duas cultivares de A. xanthorrhiza (uma sensível e outra tolerante ao calor) sob diferentes temperaturas usando sequenciamento de RNA (RNA-Seq), obtendo assim, informações sobre quais genes são diferencialmente expressos entre as cultivares e entre as diferentes temperaturas. A hipótese é plausível pois será realizada a montagem de novo do genoma, método utilizado em espécies que não apresentam genoma de referência sequenciado. As cultivares serão expostas às temperaturas de 18 e 32 °C, por 14 dias, totalizando 4 tratamentos e três repetições. O RNA será extraído e serão construídas bibliotecas de cDNA, e em seguida sequenciadas. Será realizada a montagem de novo do transcritoma, identificados os genes diferencialmente expressos, anotada a ontologia gênica (GO), identificadas as rotas metabólicas (KEGG) e as vias de sinalização acionadas em cada cultivar em resposta ao calor. As sequências de RNA obtidas serão depositadas no banco de dados de acesso público NCBI/SRA. Espera-se identificar expressão diferencial em genes do sistema de enzimas antioxidantes, fitormônios e fatores de transcrição.
  • Universidade Tecnológica Federal do Paraná - PR - Brasil
  • Tue Apr 26 00:00:00 BRT 2022-Wed Apr 30 00:00:00 BRT 2025
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Tacio Vinicio Amorim Fernandes

Ciências da Saúde

Farmácia
  • identificação in silico de novos inibidores da bcr-abl1 para a luta contra a leucemia mieloide crônica
  • A leucemia mieloide crônica (LMC) é uma neoplasia mieloproliferativa e foi a primeira doença neoplásica associada a uma anomalia genotípica bem definida – presença do cromossomo Filadélfia. A descoberta do gene de fusão breakpoint cluster region (BCR) – Abelson Murine Leukemia (ABL) revolucionou o tratamento de pacientes com LMC, permitindo o desenvolvimento de fármacos direcionados que inibem a atividade da tirosina cinase da oncoproteína BCR-ABL1. Inibidores de Tirosina Cinase (ITCs) são a terapia padrão para LMC e aumentam muito as taxas de sobrevida, apesar dos efeitos adversos. As opções de terapia disponíveis não são totalmente eficazes em reduzir a ameaça da doença em todos os pacientes, principalmente aqueles com a mutação T315I. Este projeto visa propor e sintetizar novos ITCs, que atuem na BCR-ABL1. Ferramentas in silico serão empregadas para construção de Modelos Farmacofóricos (MFs) individuais e consenso baseados tanto nas características do ligante, quanto do receptor e do complexo. Com auxílio destes modelos, ensaios de Triagem Virtual baseada em MFs serão aplicados para a filtragem de compostos de diversas bases de dados. Propriedades farmacocinéticas e toxicológicas serão preditas para todas moléculas selecionadas. Aquelas com características promissoras serão utilizadas como entradas para uma estratégia de consensus docking utilizando múltiplas conformações da BCR-ABL1 selvagem e mutante (ensemble docking). Os complexos melhores classificados serão submetidos a simulações por Dinâmica Molecular para refinamento e extração da energia de ligação pelos métodos de MMPB/GBSA. Os resultados ajudarão especialistas a identificar regiões para um processo racional de modificação molecular com objetivo de desenvolver potenciais fármacos com maior potência, seletividade e segurança contra a BCR-ABL1.
  • Fundação Oswaldo Cruz - RJ - Brasil
  • Thu Jul 14 00:00:00 BRT 2022-Wed Jul 31 00:00:00 BRT 2024