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Projetos de Pesquisa

 

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Pedro Alexandre Favoretto Galante

Ciências Biológicas

Genética
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  • precisecaller: uma plataforma completa, escalonável, de fácil uso e de código aberto para detecção de variantes genômicas em oncologia e medicina de precisão
  • A medicina de precisão busca personalizar o tratamento médico com base nas características genéticas dos pacientes, sendo especialmente relevante em oncologia. Para isso, a detecção precisa de variantes genéticas como variantes pontuais (single nucleotide variants - SNVs) e variações estruturais é crucial. Contudo, muitas ferramentas de bioinformática atuais apresentam limitações, como alta taxa de falsos positivos e necessidade de recursos computacionais extensos. Neste projeto, objetivamos desenvolver uma ferramenta denominada PreciseCaller, a ser oferecida na forma de código aberto, para identificar de forma completa e eficiente, todos os principais tipos de variantes genéticas em amostras tumorais. Esta ferramenta será capaz de detectar SNVs, pequenas inserções e deleções (Indels), inserções de elementos móveis (retroelemento) e até mesmo novas inserções de vírus exógenos. A ferramenta PreciseCaller será projetada para ser de fácil uso, bem documentada, de instalação simples e escalonável, para ser executada (caso necessário) em uma estrutura de computação em nuvem. Ou seja, esta ferramenta pretende oferecer não apenas altíssima precisão na chamada de variantes, mas também reduzirá custos operacionais, tornando esse passo da medicina de precisão mais acessível para profissionais sem um conhecimento técnico-especializado em bioinformática e viável em centros médicos com infraestrutura computacional limitada. Portanto, a criação de uma ferramenta assim tem o potencial de democratizar a detecção de variantes genéticas em oncologia. Além disso, a consequência mais significativa será posterior à identificação de tais variantes, pois tais informações irão criar a possibilidade de tratamentos mais direcionados, os quais devem aumentar a sobrevida e a qualidade de vida de pacientes oncológicos, incluindo aqueles do SUS.
  • Hospital Sírio-Libanês - SP - Brasil
  • 12/12/2023-31/12/2026
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Pedro Alves Lemos Neto

Ciências da Saúde

Medicina
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  • desenvolvimento pré-clínico e clínico de terapia celular para reparação cardíaca em pacientes com isquemia miocárdica crônica
  • O infarto agudo do miocárdio é considerado a principal causa de morte dentre as doenças cardiovasculares, o paciente acometido por essa doença apresenta insuficiência no fluxo sanguíneo, baixa taxa de oxigenação cardíaca, e como consequência há lesão isquêmica no miocárdio, apoptose de cardiomiócitos, podendo haver hipertrofia em áreas não necróticas devido à sobrecarga gerada. Alternativas para o tratamento de miocárdio isquêmico tem sido alvo de intensa investigação nos últimos anos e a terapia celular com células-tronco é uma das grandes promessas na área. Nosso grupo tem demonstrado que células-tronco mesenquimais obtidas do tecido adiposo em modelo animal são fontes promissoras para a terapia celular no contexto do infarto do miocárdio, com diminuição da deterioração do coração, com formação de novos vasos sanguíneos, e remodelamento da matriz extracelular. Atualmente não existem no Brasil estudos nos quais tenha sido avaliada particularmente a segurança da injeção de diferentes doses de células hCTM no coração. Sendo assim, o objetivo deste trabalho será avaliar a biodistribuição e segurança associados a aplicação de células estromais mesenquimais intracardíaca para subsidiar subsidiar o desenvolvimento de um produto de terapia celular nacional combinada à cirurgia de revascularização miocárdica em pacientes portadores de doença arterial coronária. É extrema importância destacar que as pesquisas e desenvolvimentos de terapias celulares hoje são dominadas por grandes indústrias, tornando os tratamentos excessivamente caros e inacessíveis para a maioria da população. Para democratizar o acesso a esses tratamentos, é crucial investir em uma terapia celular nacional, assim reduzindo drasticamente os seus custos, tornando mais acessíveis, especialmente os pacientes do Sistema Único de Saúde (SUS) no Brasil, ampliando o impacto ao acesso de saúde de qualidade para toda a população.
  • Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein - SP - Brasil
  • 18/12/2023-31/12/2026
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