Projetos de Pesquisa

 

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Rodrigo Cayô da Silva

Ciências Biológicas

Microbiologia
  • programa de monitoramento de ecossistemas microbianos fluviais e sua relação com a emergência e disseminação de patógenos multirresistentes no brasil: projeto prometeus
  • Os rios têm recebido uma carga de resíduos, incluindo antimicrobianos, favorecendo a transferência de ARGs entre bactérias patogênicas e ambientais, e pressão seletiva sobre fungos. Portanto, o saneamento básico precário no Brasil é preocupante, uma vez que uma alta frequência de colonização intestinal por BGNs MDR foi relatada na comunidade em países em desenvolvimento associada ao consumo de água contaminada. Assim, nosso objetivo é detectar a presença de patógenos MDR e de novos ARGs em ecossistemas aquáticos no Brasil, a partir da análise de amostras de água dos maiores rios (Amazonas, Paraná, São Francisco, Tocantins, Parnaíba, Uruguai, Paraíba do Sul e Rio Doce) das principais bacias hidrográficas. Serão coletadas amostras de água de três pontos distintos (4 L/ponto) de cada rio selecionado. As coletas ocorrerão no verão e inverno e as amostras de água serão mantidas a 4ºC, até o seu processamento, para cultivo de bactérias, fungos e extração de DNA total (detecção de micro-organismos não cultiváveis). Amostras de água potável serão coletadas próximo aos pontos de coleta. As amostras serão filtradas em membranas 0.45 µm, incubadas em TSB/4h, e semeadas em placas de CHROMagarTM, Bile Esculina e Manitol contendo diferentes antimicrobianos. Para a seleção de fungos, as amostras de água serão semeadas em seis diferentes meios de cultura. O gênero/espécie dos isolados será identificado por MALDI-TOF MS MS e provas bioquímicas ou por macro/micromorfologia da colônia. Os isolados serão armazenados a -20ºC. O teste de sensibilidade aos antimicrobianos será realizado por disco-difusão e diluição em ágar (bactérias), principalmente, e por microdiluição em caldo (fungos). Diferentes ARGs serão triados por PCR nos isolados bacterianos de acordo com o fenótipo de resistência, enquanto os isolados de fungos MDR terão os genes de interesse sequenciados. Cepas apresentando fenótipos MDR e/ou genótipos de interesse serão submetidas ao sequenciamento de genoma completo.
  • Universidade Federal de São Paulo - SP - Brasil
  • 05/12/2023-31/12/2026